El Centro Mixto UGR-MADOC (CEMIX) dispone de seis unidades, un órgano de dirección y un órgano asesor científico-técnico.
Su composición, competencias y funcionamiento se fijan en el Reglamento de Funcionamiento UGR-MADOC.
Las seis unidades que componen el CEMIX son las siguientes:
El órgano de dirección del CEMIX es el Consejo de Dirección.
El órgano asesor científico-técnico del CEMIX es el Comité Científico.